いただきます的意思有两重。
第一重意思是对参与制作食物的人们表示感谢。
第二重意思是表示从食物那里取得生命，来维持自己的生命。
而后两个链接则更倾向于第二重意思。换句话说，这句话其实是一句略语，完整句子是
私の命のために動植物の命を頂きます（いただきます）
意思是为了我的生命延续，我从动植物那里获取它们的性命。（暗含着要感谢这些为我而死的生灵。此处可以参考电影《阿凡达》。）

懂日语的朋友们可以自己去链接里去了解更多信息，这里就不做全文翻译了。

所以，综上所述，现有的两个答案都不能说全错。
我个人认为，这种说法的原本起源，应该是第二重取得动植物生命的意思，但由于现实当中不求甚解的人不在少数，所以在人群中难免形成第一重意思的推断。而这种推断并不影响这种说法的存在意义，并且还更加深了一层向善、感恩的意思，故而也渐渐地被接纳了。

不知各位意下如何？
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